虽然女娲娘娘乃先天圣人，又称万灵之宗、大地之母，出身混沌未知生灵，除了鸿钧、盘古、太一之外估计没人知道她的真身。她受大道鸿钧三大使命之造物使命，拥有三大不世之功其一：抟土造人、演化万物。受师弟太一之邀加入妖族。在抟土造人之时定三才人道，同时创立妖教，为妖教教主。之后她以一系列动作壮大妖族：转化妖之祖、圣人之身坐镇种族气数、妖人两族合为一道倍增妖族气运、将所创天地生灵划入妖族……可以说，没有女娲，妖族天庭虽能创建，但绝没有日后那般辉煌。
可惜，女娲虽是妖族最为辉煌的象征，但是作为圣人她不便插手，作为妖族至高无上的至圣教主，眼看巫妖大战妖教覆灭。女娲娘娘取混沌魔神伏羲尸首，在炼天炉中炼制而成屠巫剑交给帝俊执掌。而东皇太一又执掌东皇钟（混沌钟）。
巫妖双方斗的难分难解，东皇太一的伴生至宝混沌钟，三大先天至宝之一，上古妖族天庭的镇压气运之物。呈玄黄色。钟体之上，混沌之气勃然而发。钟体外满天星斗环绕其上、钟体内有日月祥光隐现其中。五色毫光照耀诸天。
主宰时空造化，拥有镇压混沌之威、颠倒时空之力、炼化阴阳之功、扭转乾坤之能。此宝玄妙无限、造化无穷，可以禁锢时间、镇压空间。防御力之强无与伦比，一旦祭出便是“立于不败之地“。此宝可开天辟地，镇压鸿蒙气运，演天道运转；可扭曲时空，颠倒阴阳，任何非圣在混沌钟面前毫无抗衡之力。
可惜，不成圣，功不成，因东皇太一尚未成道，并非天道圣人，所以不能彻底镇压妖教气运，巫妖大战时不能彻底发挥至宝威能，最终，双方发死力，双双破败，众祖巫合身自爆，与东皇太一、帝俊等人同归于尽。其中，妖师鲲鹏偷取河图、洛书，逃之夭夭。
经此一战，太一、帝俊与祖巫俱身损，妖神、大巫死伤无数。剩余残存者有的隐退躲藏，有的散落洪荒星辰之中迷失方向。许多巫族残存者退隐幽冥地府，妖族残存者退守北俱芦洲。巫妖两族由此势弱。两族同归于尽，自此没落，人教大兴。
巫妖大战后，东皇太一陨落，人族大兴，各个天道圣人遂开派立教。太上老君所创的人教、元始天尊所创的阐教、通天教主所创的截教兴起。三清继承盘古大弟子名号，是为亲传弟子，三清各自所创的人教、阐教、截教合在一起称为盘古正宗，也称玄门，后统称道教，天庭不可一日无主，三清推举鸿钧身边童子（昊天）为天庭玉帝、童女（瑶池）为天庭王母.人间界仍有大巫部落，视妖族、人类为一族（人为女娲所造，加上老子抢分人道、强立人教之前，人道妖道，合为一体，曾加入妖族大军攻打巫族），仍大战不休。九黎部落蚩尤举部落之力，以巫族秘术造十二都天神煞大阵，欲聚十二祖巫之灵为己所用。但人教大兴，轩辕拜师于广成子（广成子为阐教十二金仙之首），广成子助轩辕对抗蚩尤（又有昊天天帝派九天玄女赠送天书），灭其部落，轩辕遂为人皇。
轩辕黄帝屡屡得胜。蚩尤战败，巫族众人痛苦不堪。由于轩辕战蚩尤时，昊天天帝派九天玄女赠送天书支援，于是大巫刑天一怒之下欲伐天庭，逆天而行。刑天大战昊天天帝，被昊天天帝一剑斩下头颅，不料刑天怨念太深，冲天的暴戾之气吓跑了昊天天帝。
由于九凤乃祖巫强良胞妹，巫族残余势力以九凤为首，大巫九凤，是巫族的一个特例，是除十二祖巫外盘古血脉最为纯正的巫族，也是除十二祖巫之外唯一拥有元神的巫族。她和祖巫强良一同孕育而出，是祖巫强良的胞妹、玄冥巫法的唯一传人，实力仅次于十二祖巫。
当年巫妖大战，九凤跟随玄冥一同杀上洪荒天庭，令无数妖神闻风丧胆。巫妖大战，洪荒破碎，其余祖巫殒尽，祖巫玄冥与东皇太一同归于尽，九凤便为残存的巫族首领。
她召集剩余巫族中人，开始与人族争夺利益。奈何人族合该大兴，有三大圣人坐阵，压住人族运势，妖族就一个女娲娘娘圣人，就让妖族在洪荒年代如此辉煌。如今人族在三大圣人羽翼之下焉之不兴旺。在加精心算计。
巫族最终被除尽（逃跑，或者死亡）。随后，人巫两族主张以和为贵，不料巫族首领九凤被颛顼偷袭算计，中了轩辕剑后重伤，逃进了洪荒星空。在洪荒星空中，九凤恢复伤势，更炼化了三颗太古星辰（七杀、破军、贪狼）。随后打算回到洪荒人间，杀死转世的颛顼，以报被辱之仇。至此，巫族、妖族两族的辉煌彻底销声匿迹，不复存在。
妖族销声敛迹之后，天庭由鸿钧身边童子（昊天）为玉帝，大量缺乏正神。昊天想构造天庭结构，自己真正做天庭主人，而不是什么傀儡。就想编成三百六十五位正神，共分八部，上四部：雷、火、瘟、斗；下四部：群星列宿、三山五岳、布雨兴云、善恶之神。
昊天玉帝就想命元始天尊门下12金仙称臣，这样12金仙就成了自己手下，这12金仙都是洪荒过后拜入圣人门下，都是除了圣人以下大能之辈，都是心高气傲之辈，岂能屈服小小
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来源4：kujiang